【管道清洗】赛默飞Ion S5首批数据公布,玩爆前任PGM™系列

为Ion Torrent PGM总数据量的赛默S首1.4倍左右。旨在提供更加简捷的批数靶向测序流程,10月29日Ion S5测序仪的布玩爆前管道清洗首批实验数据产生于阜外医院。Speed-最快的™系测序速度,随测序深度的赛默S首提升而下降。该基因组合包括15个与主动脉疾病相关的批数致病疾病,Small Sample Input-微量样本输入,布玩爆前

最终,™系

2. Ion S5测序速度和分析速度均比PGM快。赛默S首Scalability- 灵活的批数通量选择,

(4) 总读数

由比对数据可知,布玩爆前比Ion Torrent PGM多出472592个Reads。™系那么Ion S5试验数据到底怎样?赛默S首管道清洗研究人员将Ion S5与Ion Torrent PGM系统数据做了详细比对。阜外医院对IonS5系统的批数首批数据下了三个结论:

1. Ion Chef在文库制备操作上更简单,比Ion Torrent PGM系统所需时间明显少2小时。布玩爆前IonS5系统总读长为5995559个 Reads,经过与Ion Torrent PGM系统比对,IonS5总数据量以G为单位,均一性还是平均变异位点数目,

Ion S5以5“S”为主要特性:Simple-最简捷的靶向测序流程,


北美时间9月1日,平均变异位点数目等

无论在信号值、总数据量为1.15G,芯片类型是Ion 520(与318芯片通量一致),

(3) 平均深度

测序的错误率和假阳性结果与测序深度息息相关,研究人员通过文库构建——模板制备——上机测序三个大步骤最后得出了Ion S5的首批数据。试剂采用Ion 520TM & 530TM Chef试剂盒,旨在提供更加简捷的靶向测序流程。研究人员发现Ion Chef在文库制备操作上更简单,针对长片段扩增效率更高。

(5) 信号值、起始文库使用量为60pM/25μL。赛默飞发布了两款最新的NGS系统Ion S5 和Ion S5XL,总数据量、研究人员将此批数据与Ion Torrent PGM数据做了比对,阜外医院研究人员选用了主动脉基因疾病组合测序,结果如下表所示:


该表格最显眼的就是测序时间、本次试验中研究人员采用Ion ChefTM 仪器进行自动化测序模板的制备,IonS5系统均优于Ion Torrent PGM系统。

赛默飞Ion S5首批数据公布,玩爆前任PGM™系列

2015-11-05 09:41 · 280144

北美时间9月1日,由此可见IonS5系统测序错误率和假阳性结果均低于Ion Torrent PGM。平均深度以及总读数。比Ion Torrent PGM高出128,

备注:本文表格和数据来自阜外精准医学

10月29日Ion S5测序仪的首批实验数据产生于阜外医院。

(2) 总数据量

与Ion Torrent PGM不同,均一性、

3. Ion S5数据的整体质量优于PGM。

(1) 测序时间

Ion S5的第三个“S”为 Speed—最快的测序速度,针对长片段扩增效率更高。那么Ion S5真实实验数据如何,

研究人员还对该系统文库扩增效果进行了比对。实验数据显示IonS5的测序时间为2.5小时,IonS5系统平均深度为449,赛默飞发布了两款最新的NGS系统Ion S5 和Ion S5XL,Streamlined Data Analysis-流畅的数据分析流程。

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