下一代测序技术(next generation sequencing，
检测先证者父母及其他家庭成员，临床外显子名义上包含所有已知的致病基因，临床共享资源的集中开发，最终会将我们带入全基因组测序的时代。
四、提高临床功效性。分析界定可报、
六、目前临床仍在不断积累经验以争取最大程度地发挥NGS在罕见遗传病诊断中的功效，全基因组测序已经开始常规用于拷贝数变异(copy number variation，希望随着临床检测质量管理的加强，这些因素都增加了变异临床意义分析的难度。这在严重智力障碍和自闭症谱系障碍等患者中已经得到了充分证明。比如产前检测，临床外显子组或全外显子检测结果分析在很大程度上依靠对基因型-表型相关性的了解，
本文转载自中华检验医学杂志，全外显子组及全基因组的检测[5]。如1型神经纤维瘤；(2)致病基因的变异不能为NGS所检测，目前很大一部分的变异只能归类为临床意义不明。大大提高了分子诊断用于遗传病患者的效率。
二、通过从遗传疾病知识库[如在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man，目前HPO收录了11 000个和异常表型对应的词条，妊娠史、已知超过5 000个基因被发现与人类疾病相关，从而间接降低医疗成本，对于先证者标本，临床表现与可能的干预和治疗措施以及预后情况；结合心理评估识别患者及家属在情感、下面就诊断流程的几个主要方面作简要讨论。因为一是新致病基因的发现速度很快，
五、从而能够优先考虑和临床症状相关的基因的罕见功能性变异。过去所报告的致病变异可能并非真的致病性变异，过低的测序覆盖度会导致漏检真正的变异，因此变异的临床解读是一项持续性的工作。临床上有效鉴别是否为遗传性疾病，但实际上由于各公司产品设计不同、在NGS时代，临床外显子、对一个变异的分析有时需要花费大量时间精力查找阅读相关文献及数据库，LP)，并提供了系统的分类管理[4]。这就需要通过临床相关性分析来决定，不同的突变需要用不同的检测手段。在一些情况下是必须的，最常见的是核心家系的检测(父母加先证者，可以为临床医生描述畸形症状提供指导和依据。由于NGS检测费用相对昂贵，同时检测父母非常有助于快速鉴定是否为新发变异。目前主要的任务是培养一批掌握基因组学知识，主要看症状的吻合程度，因此实验室间共享经验、根据美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics，中文版开放平台的建立将对中文使用者的临床和科研工作起到极大的推动作用。除了要考虑相符的症状外，但全基因组测序还没有常规性用于序列变异的检测，某些基因区域存在同源序列等原因，笔者认为，遗传咨询的对象包括送检医生、达到共赢的目的，可能良性(likely benign，选择恰当的检测方法罕见遗传病的病种很多，变异的临床相关性分析及报告ACMG指南将序列变异的临床意义分为五类：致病性(pathogenic，Pubmed等]中搜寻基因与疾病、报告变异内容主要取决于以下几个原则：(1)对于诊断性检测，并能充分了解检测结果对家庭其他成员的潜在影响，提供知情同意的解释。包括对先证者的家族史、变异的临床意义分析分析序列变异的临床意义不是一个简单或直接的过程。AMP)测序变异的致病性分析指南为我们制定了统一的原则，迄今，因此有必要进行测试前的遗传咨询。基于NGS的分子检测可以根据检测对象的多少分成单基因、这对于评估隐性遗传病特别重要。有助于患者尽早开展治疗干预，特别是对OMIM、根据患者或家属的选择来决定。相同的变异在不同的评估原则下可能会呈现不同结果，CNV)的分析，临床医生在鉴别时需要综合考虑多种因素，教育、
下一代测序技术促进罕见遗传病的诊治和咨询
2017-08-01 06:00 · wenmingwNGS是对传统一代测序技术的革命性改变，基因包、准确的临床表型信息是基因诊断的基础和出发点，单基因的检测仍然很有必要，全外显子组测序自2009年用于罕见遗传病分子病因学研究和诊断以来[1]，患者及家属需要专业人员为其提供遗传咨询。需要作鉴别诊断的病种较为合适，全外显子组测序自2009年用于罕见遗传病分子病因学研究和诊断以来，普瑞德威利-天使综合征的甲基化分析等。达到改善预后、可能致病性(likely pathogenic，咨询还应包括介绍此类测试的替代方案，降低疾病严重性的目的。即便如此也不一定能得出比较肯定的结论，实验室有必要开展功能性研究，另一方面也可能因不能有效过滤一些不真实的变异及界定不正确的合子状态而导致假阳性。临床意义不明(uncertain significance，导致全外显子组测序无法对基因组的所有编码区域进行有效捕获与测序。相信随着新的测序技术的突破，
七、B)[7]。
三、过去分析过的一些变异在一段时间后或有新的证据出现后需要进行重新分析，因此全面准确地评估临床表型并用统一的标准术语描述记录尤为重要。遗传咨询是遗传检测不可缺少的重要环节，这是一项有待发展的重要方向。P)，一些不相符的症状在分析过滤变异时会被鉴别剔除。中国遗传咨询师的主要工作是为临床医生及患者就基因检测报告提供针对性的诠释及咨询，大多数严重影响个体生殖健康的高外显性疾病往往是由于新发变异造成的，
九、包括权威性的信息源(书籍文献网站等)、最终为患者提供更有效的服务[8]。作者沈亦平、美国形态学要素协作组对体表畸形术语的标准化及含义作了定义，专家库、该技术具有高通量和低单碱基成本的特点。VUS)，
经济以及心理等社会资源，共享变异分析的结果是非常必要的，如全外显子组的测序，目前对是否报道检测目的外的基因变异意外发现还没有统一的规定，造成假阴性，(2)与本次检测目的无关的、基因包的检测对临床有特异表型但遗传异质性较强，(3)一般良性和可能良性的变异不会被纳入报告中。也取决于已知致病基因能解释这类疾病的比例。LB)和良性(benign，只需很低的覆盖度(比如0.1X)就能检测出全基因组范围内的CNV，国内有关组织也有建议[9]。全外显子组理论上应包含基因组的所有编码区域，对于预测性检测，评估疾病或症状的发生风险与再发风险以及生育的建议；解释遗传疾病的发病原因、因此变异的临床意义分析应基于最新的证据。测序覆盖度对变异检出率有至关重要的影响。对明确致病变异很有帮助。我国尚无一套针对NGS检测进行遗传咨询的原则和操作规范，要求90%～95%区域的平均测序覆盖度应达到100X，对于没有其他依据可循的变异，主要应用于以下一些情况：(1)临床能明确诊断、意外发现的变异是否纳入报告取决于测试前遗传咨询结果，由于新基因不断被发现，其临床功效也在很大程度上取决于临床医生对临床诊断的把握度，表型与基因的相关性，一、OMIM)，项目种类也较多，这也是测试前咨询的重要内容[3]。Orphanet，建立标准化流程和质量保障措施，通过制定共识性原则的、笔者认为，HPO)也对人类疾病异常表型的标准化术语进行了规范化。并具备一定临床知识的遗传咨询师。结语NGS为罕见病的早期确诊提供了可靠的技术平台，互助组织等信息；引导患者及家属参与诊断及研究项目，也要考量不相符的症状。此外，教育以及文化等方面的理解及接受问题；评估患者和(或)家庭成员对出现疾病或存在疾病再发风险的理解及反应程度；充分了解并为患者及家属提供有效的医学、基因包也需不断地更新。且各有其优势和局限性，疾病自然发展史、测试前的遗传咨询遗传检测是一项比较复杂的临床检测项目，遗传性罕见病的临床初步鉴别绝大多数罕见病有遗传基础，患者和家属。从而确认变异的顺式或反式(复合杂合)的构型，环境毒理、家庭社会生活环境的全面了解。Orphanet和DECIPHER中记录的7 000多种罕见病及4 000多种常见病提供了HPO的注释，NGS)是对传统一代测序技术的革命性改变，
八、并为送检医生及患者提供相关的建议。需要在实践和研究中总结发展。由于对疾病基因致病机制了解不够充分，能提高NGS对罕见病的诊断率，临床报告中重要的部分是提供支持变异分类的证据及证据的来源，以保证检测技术的有效性。