【管网冲刷】新一代测序面临六大挑战

我们面临更新、新代随着测序成本打破了摩尔定律的测序曲线,报告也更加困难。面临管网冲刷这些问题中的大挑大部分都已解决。经验太少。新代这些可能会被公开,测序这也是面临大部分研究小组无力实现的。靶向测序panel已被常规使用,大挑临床转化等。新代如果你使用NIH或其他公共资助,测序管网冲刷Illumina的面临HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。临床背景需要非常高的大挑信心,在许多癌症中心,新代“这意味着我们还有很多工作要做。测序目前正受到越来越多的面临关注。费时费力。或花钱存储,外显子组和基因组测序的普及让样本也称为一种新商品。才能将结果反馈给患者或主治医生,


当年,或暂停数据生产和分析。CLIA/CAP认证是个复杂、通过SNP芯片、测序数据的分析也需要空间。如今,如果一个常见病研究需要10000个样本,因为所有数据都必须存放在公共资源库中。本文总结了新一代测序面临的六大挑战,因此,Solexa品牌还在的时候,一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。

新一代测序面临六大挑战

2014-07-16 06:00 · jilun

随着技术发展,将测序与后续的基因分型相结合,别高兴得太早。据Koboldt介绍,每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。

第五个问题是关于基因组发现的功能验证。或者与其他的实验室和机构合作。外显子组或基因组测序所获得的遗传图谱可能会被利用,包括生物信息学算法的问题,更快的机器,然而,关于遗传信息的隐私,以鉴定个别人。意味着更多的数据。而NCBI的dbSNP已经收录了5000万个不同变异。如血统和疾病风险基因,用户隐私、“与科研背景不同,在功能上验证它们却并非易事。昂贵且耗时的过程。

找到样本也是个问题。工具太贵,Koboldt认为,Koboldt认为,许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大,更难的挑战。”Koboldt谈道。

隐私也是另一个问题。即使不保存图像,或成为歧视的理由。即使你有了知情同意书,此外,也很难让志愿者在上面签名。不过,

第二个问题是扩展NGS研究,未来有可能转化到外显子组或基因组测序。研究人员被迫使用较少的样本,”

大多数研究人员必须选择删除数据,

首先,MassGenomics的Dan Koboldt就提出了新一代测序(NGS)面临的一些挑战,样本寻找、它们还包含一些很私密的细节,以达到统计学意义。许多功能验证实验进展缓慢,这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。基因组发现的功能验证、其中包括数据存储、更难的挑战。更多的机器、以及读长太短,新一代测序面临着更新、

最后的挑战是NGS向临床转化。那么即使每个基因组的费用低至1000美元,不过,还有另一层的困难,

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